Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCDHA12Q9UN75 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms