Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms