Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms