Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms