Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFA12Q9UI09 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms