Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGXB4Q9UGU5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms