Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VTI1BQ9UEU0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTI1BQ9UEU0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms