Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms