Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms