Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCC13Q9NSE7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms