Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC6A13Q9NSD5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms