Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms