Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms