Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLCO1B3Q9NPD5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLCO1B3Q9NPD5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms