Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms