Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BCAS3Q9H6U6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BCAS3Q9H6U6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms