Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms