Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms