Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms