Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms