Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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