Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDEM3Q9BZQ6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms