Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms