Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5DQ9BY66 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5DQ9BY66 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms