Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms