Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MCMBPQ9BTE3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCMBPQ9BTE3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms