Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MESP1Q9BRJ9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms