Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL2Q9BQD1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms