Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms