Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP9Q99956 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP9Q99956 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms