Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAT1Q99536 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms