Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms