Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms