Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms