Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD4Q96KN9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms