Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms