Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A3Q96HJ5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A3Q96HJ5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms