Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIRT1Q96EB6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms