Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELP4Q96EB1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms