Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC39Q96DD0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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LRRC39Q96DD0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC39Q96DD0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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