Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG2BQ96BY7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms