Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFKQ969G6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms