Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR2Q969E8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms