Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIPC3Q8TF64 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIPC3Q8TF64 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms