Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms