Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL11Q8NHH1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms