Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3C3Q8NEB9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms