Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNBD1Q8NA66 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms