Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms