Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPAP2Q8IXW5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms